Dr. Goran Kungulovski

2015
Doktor i Shkencave (PhD) në Biokimi dhe Epigjenetikë (summa cum laude)
Instituti i Biokimisë, Universiteti i Shtutgartit, Gjermani
Mentor: Prof. Albert Jeltsch

2012
Master në Shkencat Molekulare të Jetës (summa cum laude)
Fakulteti i Inxhinierisë dhe Shkencave Natyrore, Universiteti Jacobs Bremen, Gjermani

2010
Inxhinier i diplomuar në Biologji
Drejtimi Biokimi-Fiziologji, Fakulteti i Shkencave Natyrore dhe Matematikës, Universiteti “Shën Kirili dhe Metodi”, Shkup, Maqedoni.

2016 – sot

Bashkëthemelues dhe Drejtor Shkencor
Laboratori për Diagnostikë Molekulare dhe Gjenomikë Precize
Klinika Zhan Mitrev, Maqedonia e Veriut

• Drejton segmentin kërkimor-shkencor dhe zhvillimor, si dhe operacionet strategjike të laboratorit, duke nxitur inovacionin në diagnostikën molekulare dhe gjenomikën precize.
• Merr pjesë aktive në aktivitetet kërkimore dhe analitike në të gjithë spitalin, duke kontribuar në avancimin e mjekësisë precize dhe përmirësimin e rezultateve te pacientët.

2016 – sot

Konsulent shkencor dhe teknologjik
Kompani IT dhe bioteknologjike, UNDP dhe Komisioni Evropian

Ofron konsulencë profesionale në fusha të ndryshme, duke përfshirë:

• zhvillimin e softuerëve për testime farmakogjenetike dhe gjenetike;
• planifikimin strategjik për kompani që prodhojnë reagentë për biologjinë molekulare;
• themelimin dhe optimizimin e kapaciteteve laboratorike.

Gjithashtu angazhohet si:

• recensent shkencor i jashtëm;
• vlerësues;
• monitorues për Komisionin Evropian,

duke marrë pjesë në vlerësimin dhe mbikëqyrjen e projekteve shkencore të nivelit të lartë.

Nga viti 2024, vazhdon edhe si konsulent i kompanisë Bio Engineering.

2023 – sot

Bashkëthemelues dhe Drejtor Ekzekutiv (CEO)
Fingerprint Diagnostics LLC, Maqedonia e Veriut

Ka luajtur rol kyç në:

• themelimin e kompanisë;
• procesin e kërkimit dhe zhvillimit;
• integrimin e aktiviteteve shkencore dhe operative.

Kontribuoi në sigurimin e një projekti Horizon 2020 nga Komisioni Evropian.

Është përgjegjës për harmonizimin e teknologjive inovative për zbulimin e hershëm të kancerit me nevojat e tregut dhe zhvillimin e zgjidhjeve diagnostikuese me rëndësi të lartë klinike.

Drejton zhvillimin shkencor të:

• teknologjive multi-omike;
• analizave të bazuara në Nanopore;
• analizave të bazuara në Illumina;
• diagnostikës jo-invazive nga gjaku për zbulimin e hershëm të kancerit dhe sëmundjeve të tjera.

Pozicionet e mëparshme

2016 – 2024

Drejtor për Shkencë dhe Zhvillim (CSO)
Bio Engineering LLC, Maqedonia e Veriut

Përgjegjës për:

• zhvillimin shkencor;
• zhvillimin klinik;
• zhvillimin operacional;
• krijimin e partneriteteve strategjike me klinika.

Në bashkëpunim me Klinikën Zhan Mitrev, pati rol thelbësor në themelimin e:
Laboratorit për Diagnostikë Molekulare dhe Gjenomikë Precize, duke nxitur inovacionin në diagnostikën molekulare dhe mjekësinë precize.

2012 – 2016

Bashkëpunëtor Shkencor
Instituti i Biokimisë, Universiteti i Shtutgartit, Gjermani

Drejtoi kërkimet dhe zhvillimin në fushat e:

• hartëzimit të kromatinës;
• editimit të epigjenomit.

Menaxhoi me sukses një ekip prej më shumë se 5 studiuesish, duke përfshirë:

• studentë të diplomuar;
• studentë të masterit;
• doktorantë,

në kuadër të projekteve ndërkombëtare kërkimore të financuara me grante.

Publikime shkencore në fushën e epigjenetikës dhe kromatinës

• DNA methylation variability defines a fundamental dimension of tumor epigenomes linked to genomic instability, tumor aggressiveness, and clinical outcomes – Djansel Bukovec, Blagojche Gjorgjioski, Monika Simjanoska Misheva, Goran Kungulovski (corresponding author) (Epigenetics and Chromatin, 2026 under review)

• Mutations in chromatin regulator genes associate with TMB and immunotherapy response in melanoma Marija Gjorgjievska, Djansel Bukovec, Andzelka Ilieva, Milan Risteski, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Aimilios Lallas Goran Kungulovski (corresponding author) (Pigment Cell & Melanoma Research, 2026 under review)

• Tumors with mutations in chromatin regulators are associated with higher mutational burden and improved response to checkpoint immunotherapy – Marija Gjorgjievska, Sanja Mehandziska, Djansel Bukovec, Milan Risteski, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author) (Clinical Epigenetics, 2026)

• Refined read-out: the hUHRF1 Tandem-Tudor domain prefers binding to histone H3 tails containing K4me1 in the context of H3K9me2/3 – M Choudalakis, Goran Kungulovski (co-author), R Mauser, P Bashtrykov, A Jeltsch (Protein Science, 2023)
• Application of mixed peptide arrays to study combinatorial readout of chromatin modifications – R Mauser, Goran Kungulovski (co-author), D Meral, D Maisch, A Jeltsch (Biochimie, 2018)
• H3K14ac is linked to methylation of H3K9 by the triple Tudor domain of SETDB1– Renata Z Jurkowska, Su Qin, Goran Kungulovski (co-author), Wolfram Tempel, Yanli Liu, Pavel Bashtrykov, Judith Stiefelmaier, Tomasz P Jurkowski, Srikanth Kudithipudi, Sara Weirich, Raluca Tamas, Hong Wu, Ludmila Dombrovski, Peter Loppnau, Richard Reinhardt, Jinrong Min, Albert Jeltsch (Nature communications, 2017) (highly cited)

• Application of dual reading domains as novel reagents in chromatin biology reveals a new H3K9me3 and H3K36me2/3 bivalent chromatin state – R Mauser, Goran Kungulovski (first co-author), C Keup, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2017)
• Application of recombinant TAF3 PHD domain instead of anti-H3K4me3 antibody – Goran Kungulovski (first co-author), R Mauser, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2016)
• Affinity reagents for studying histone modifications & guidelines for their quality control – Goran Kungulovski (first author), R Mauser, A Jeltsch (Epigenomics, 2015)
• Specificity analysis of histone modification-specific antibodies or reading domains on histone peptide arrays – Goran Kungulovski (first author), I Kycia, R Mauser, A Jeltsch (Peptide Antibodies, Methods and Protocols, 2015), book chapter.
• Quality of histone modification antibodies undermines chromatin biology research – Goran Kungulovski (first author), A Jeltsch (F1000 Research, 2015)

• Application of histone modification-specific interaction domains as an alternative to antibodies – Goran Kungulovski (first author), Ina Kycia, Raluca Tamas, Renata Z Jurkowska, Srikanth Kudithipudi, Chisato Henry, Richard Reinhardt, Paul Labhart, Albert Jeltsch (Genome Research, 2014) (highly cited)

• The Tudor domain of the PHD finger protein 1 is a dual reader of lysine trimethylation at lysine 36 of histone H3 and lysine 27 of histone variant H3t – I Kycia, S Kudithipudi, R Tamas, Goran Kungulovski (co-author), A Dhayalan, A Jeltsch (Journal of Molecular Biology, 2014)
• Application of Celluspots peptide arrays for the analysis of the binding specificity of epigenetic reading domains to modified histone tails – I Bock, S Kudithipudi, R Tamas, Goran Kungulovski (co-author), A Dhayalan, A Jeltsch (BMC Biochemistry, 2011) (highly cited)

Publikime në fushën e editimit të epigjenomit

• Genome-wide investigation of the dynamic changes of epigenome modifications after global DNA methylation editing – J Broche, Goran Kungulovski (first co-author), P Bashtrykov, P Rathert, A Jeltsch, (Nucleic acids research, 2021)
• Efficient targeted DNA methylation with chimeric dCas9–Dnmt3a–Dnmt3L methyltransferase – P Stepper, Goran Kungulovski (co-author), RZ Jurkowska, T Chandra, F Krueger, Richard Reinhardt, Wolf Reik, Albert Jeltsch, Tomasz P Jurkowski (Nucleic acids research, 2017) (highly cited)

• Correction of aberrant imprinting by allele-specific epigenome editing – P Bashtrykov, Goran Kungulovski (co-author), A Jeltsch (Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2016)

• Epigenome editing: state of the art, concepts, and perspectives – Goran Kungulovski (first author), A Jeltsch (Trends in Genetics, 2016) (highly cited)
• Targeted epigenome editing of an endogenous locus with chromatin modifiers is not stably maintained Goran Kungulovski (first co-author), S Nunna, M Thomas, UM Zanger, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2015) (highly cited)

Publikime në fushën e diagnostikimit të sëmundjeve të rralla

• Compound Heterozygosity in Cerebellar Ataxia, Mental Retardation, and Disequilibrium Syndrome Type 4 –B Teov, A Janchevska, A Beqiri-Jasari, V Tasic, Goran Kungulovski (co-corresponding author), Z Gucev (PRILOZI 44, 2023)
• A Pediatric Case of Glioblastoma Multiforme Associated With a Novel Germline p.His112CysfsTer9 Mutation in the MLH1 Gene Accompanied by a p.Arg283Cys Mutation in in the TP53 Gene: A Case Report – Aleksandra Stajkovska, Sanja Mehandziska, Rodney Rosalia, Margarita Stavrevska, Marija Janevska, Martina Markovska, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author), (Frontiers in Genetics, 2018)
• Detection of novel and reported rare disease-causing genetic mutations in Macedonia: A Collage of Case Reports – S Mehandziska, A Stajkovska, M Stavrevska, M Janevska, M Markovska, I Kungulovski, Z Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author), (EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2019)

• Trio clinical exome sequencing in a patient with multicentric carpotarsal osteolysis syndrome: first case report in the Balkans – Aleksandra Stajkovska, Sanja Mehandziska, Margarita Stavrevska, Kristina Jakovleva, Natasha Nikchevska, Zan Mitrev, Ivan Kungulovski, Gjorgje Zafiroski, Velibor Tasic, Goran Kungulovski (corresponding author) (Frontiers in Genetics, 2018)
• Progressive Familial Intrahepatic cholestasis type3 resulting from compound heterozygosity of ABCB4 mutations – N Nikcevska, S Petrovska, S Mehandziska, M Spirovski, Goran Kungulovski (corresponding author) (EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS, 2017)

Publikime në fushën e gjenomikës precize

• Case report: omicron BA. 2 subvariant of SARS-CoV-2 outcompetes BA. 1 in two co-infection cases Marija Gjorgjievska, Sanja Mehandziska, Aleksandra Stajkovska, Slavica Pecioska-Dokuzovska, Anica Dimovska, Idriz Durmish, Sara Ismail, Teodora Pavlovska, Antonija Stojchevska, Haris Amedi, Jasna Andonova, Marija Nikolovska, Sara Velickovikj, Zan Mitrev, Ivan Kungulovski, Goran Kungulovski (corresponding author), (Frontiers in Genetics, 2022)
• Workflow for the implementation of precision genomics in healthcare – Sanja Mehandziska, Aleksandra Stajkovska, Margarita Stavrevska, Kristina Jakovleva, Marija Janevska, Rodney Rosalia, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author) (Frontiers in Genetics, 2020)

• P961 CYP2C19-dependent clopidogrel resistance is a possible cause for coronary stent and peripheral bypass occlusion – M Klinceva, S Mehandziska, E Idoski, A Stajkovska, M Stavrevska, K Jakovleva, V Ampova-Sokolov, R Rosalia, Goran Kungulovski (co-author), M Blazevska, N Hristov, I Milev, Z Mitrev European Heart Journal (suppl_1), 2019).
  

Anglisht