Д-р сци. Горан Кунгуловски

2015

Доктор на науки (PhD) по Биохемија и Епигенетика (summa cum laude)
Институт за биохемија, Универзитет во Штутгарт, Германија

Ментор: Проф. Алберт Јелч

2012

Магистер по молекуларни науки за животот (summa cum laude)
Факултет за инженерство и природни науки, Универзитет Јакобс Бремен, Германија

2010

Дипломиран инженер по биологија

Биохемиско-физиолошка насока, Природно-математички факултет, Св. Кирил и Методиј, Скопје, Македонија

2016 – денес

Ко-основач и научен раководител

Лабораторија за молекуларна дијагностика и прецизна геномика,

Клиника Жан Митрев, Северна Македонија

Го предводи научно-истражувачкиот и развојниот сегмент, како и стратешките операции на лабораторијата, поттикнувајќи иновации во молекуларната дијагностика и прецизната геномика.

Активно учествува во истражувачките и аналитичките активности низ целата болница, придонесувајќи кон унапредување на прецизната медицина и подобрување на исходот кај пациентите.

2016 – денес

Научен и технолошки консултант

IT и биотехнолошки компании, UNDP и Европска Комисија

Обезбедува експертски консултации во повеќе области, вклучувајќи:

• развој на софтвер за фармакогенетски и генетски тестирања;
• стратешко планирање за компании кои произведуваат реагенси за молекуларна биологија;
• основање и оптимизација на лабораториски капацитети.

Дополнително, работи како:

• надворешен научен рецензент;
• евалуатор;
• монитор за Европската Комисија,

при што учествува во евалуација и надзор на врвни научни проекти.

Од 2024 година продолжува и како консултант на компанијата Bio Engineering.

2023 – денес

Ко-основач и Главен извршен директор (CEO)

Fingerprint Diagnostics LLC, Северна Македонија

Одиграл клучна улога во:

• основањето на компанијата;
• научно-истражувачкиот и развојниот процес;
• интеграцијата на научните и оперативните активности.
• Добивање на Horizon 2020 проект од Европската комисија

Одговорен е за усогласување на иновативните технологии за рано откривање на рак со потребите на пазарот и развој на дијагностички решенија со големо клиничко значење.

Го предводи научниот развој на:

• мулти-омски технологии;
• Nanopore-базирани анализи;
• Illumina-базирани анализи;
• неинвазивна крвна дијагностика за рано откривање на рак и други заболувања.

Претходни позиции

2016 – 2024

Директор за наука и развој (CSO)

Bio Engineering LLC, Северна Македонија

Одговорен за:

• научниот развој;
• клиничкиот развој;
• оперативниот развој;
• воспоставување стратешки партнерства со клиники.

Во соработка со Клиника Жан Митрев, одиграл суштинска улога во основањето на:

Лабораторијата за молекуларна дијагностика и прецизна геномика, поттикнувајќи иновации во молекуларната дијагностика и прецизната медицина.

2012 – 2016

Научен соработник

Институт за биохемија, Универзитет во Штутгарт, Германија

Ги предводел истражувањата и развојот поврзани со:

• мапирање на хроматинот;
• едитирање на епигеномот.

Успешно раководел со тим од повеќе од 5 истражувачи, вклучувајќи:

• дипломци;
• магистранти;
• докторанди,

во рамките на меѓународни научни проекти финансирани преку грантови.

Публикации во полето на епигенетика и хроматин

• DNA methylation variability defines a fundamental dimension of tumor epigenomes linked to genomic instability, tumor aggressiveness, and clinical outcomes – Djansel Bukovec, Blagojche Gjorgjioski, Monika Simjanoska Misheva, Goran Kungulovski (corresponding author) (Epigenetics and Chromatin, 2026 under review)

• Mutations in chromatin regulator genes associate with TMB and immunotherapy response in melanoma Marija Gjorgjievska, Djansel Bukovec, Andzelka Ilieva, Milan Risteski, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Aimilios Lallas  Goran Kungulovski (corresponding author) (Pigment Cell & Melanoma Research, 2026 under review)

• Tumors with mutations in chromatin regulators are associated with higher mutational burden and improved response to checkpoint immunotherapy – Marija Gjorgjievska, Sanja Mehandziska, Djansel Bukovec, Milan Risteski, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author) (Clinical Epigenetics, 2026)

• Refined read-out: the hUHRF1 Tandem-Tudor domain prefers binding to histone H3 tails containing K4me1 in the context of H3K9me2/3 – M Choudalakis, Goran Kungulovski (co-author), R Mauser, P Bashtrykov, A Jeltsch (Protein Science, 2023)
• Application of mixed peptide arrays to study combinatorial readout of chromatin modifications – R Mauser, Goran Kungulovski (co-author), D Meral, D Maisch, A Jeltsch (Biochimie, 2018)
• H3K14ac is linked to methylation of H3K9 by the triple Tudor domain of SETDB1– Renata Z Jurkowska, Su Qin, Goran Kungulovski (co-author), Wolfram Tempel, Yanli Liu, Pavel Bashtrykov, Judith Stiefelmaier, Tomasz P Jurkowski, Srikanth Kudithipudi, Sara Weirich, Raluca Tamas, Hong Wu, Ludmila Dombrovski, Peter Loppnau, Richard Reinhardt, Jinrong Min, Albert Jeltsch (Nature communications, 2017) (highly cited)

• Application of dual reading domains as novel reagents in chromatin biology reveals a new H3K9me3 and H3K36me2/3 bivalent chromatin state – R Mauser, Goran Kungulovski (first co-author), C Keup, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2017)
• Application of recombinant TAF3 PHD domain instead of anti-H3K4me3 antibody – Goran Kungulovski (first co-author), R Mauser, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2016)
• Affinity reagents for studying histone modifications & guidelines for their quality control – Goran Kungulovski (first author), R Mauser, A Jeltsch (Epigenomics, 2015)
• Specificity analysis of histone modification-specific antibodies or reading domains on histone peptide arrays – Goran Kungulovski (first author), I Kycia, R Mauser, A Jeltsch (Peptide Antibodies, Methods and Protocols, 2015), book chapter.
• Quality of histone modification antibodies undermines chromatin biology research – Goran Kungulovski (first author), A Jeltsch (F1000 Research, 2015)

• Application of histone modification-specific interaction domains as an alternative to antibodies – Goran Kungulovski (first author), Ina Kycia, Raluca Tamas, Renata Z Jurkowska, Srikanth Kudithipudi, Chisato Henry, Richard Reinhardt, Paul Labhart, Albert Jeltsch (Genome Research, 2014) (highly cited)

• The Tudor domain of the PHD finger protein 1 is a dual reader of lysine trimethylation at lysine 36 of histone H3 and lysine 27 of histone variant H3t – I Kycia, S Kudithipudi, R Tamas, Goran Kungulovski (co-author), A Dhayalan, A Jeltsch (Journal of Molecular Biology, 2014)
• Application of Celluspots peptide arrays for the analysis of the binding specificity of epigenetic reading domains to modified histone tails – I Bock, S Kudithipudi, R Tamas, Goran Kungulovski (co-author), A Dhayalan, A Jeltsch (BMC Biochemistry, 2011) (highly cited)

Публикации во полето на епигеномско пре-уредување

• Genome-wide investigation of the dynamic changes of epigenome modifications after global DNA methylation editing – J Broche, Goran Kungulovski (first co-author), P Bashtrykov, P Rathert, A Jeltsch, (Nucleic acids research, 2021)
• Efficient targeted DNA methylation with chimeric dCas9–Dnmt3a–Dnmt3L methyltransferase – P Stepper, Goran Kungulovski (co-author), RZ Jurkowska, T Chandra, F Krueger, Richard Reinhardt, Wolf Reik, Albert Jeltsch, Tomasz P Jurkowski (Nucleic acids research, 2017) (highly cited)

• Correction of aberrant imprinting by allele-specific epigenome editing – P Bashtrykov, Goran Kungulovski (co-author), A Jeltsch (Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2016)

• Epigenome editing: state of the art, concepts, and perspectives – Goran Kungulovski (first author), A Jeltsch (Trends in Genetics, 2016) (highly cited)
• Targeted epigenome editing of an endogenous locus with chromatin modifiers is not stably maintained Goran Kungulovski (first co-author), S Nunna, M Thomas, UM Zanger, R Reinhardt, A Jeltsch (Epigenetics & chromatin, 2015) (highly cited)

Публикации во полето на дијагностика на ретки болести

• Compound Heterozygosity in Cerebellar Ataxia, Mental Retardation, and Disequilibrium Syndrome Type 4 –B Teov, A Janchevska, A Beqiri-Jasari, V Tasic, Goran Kungulovski (co-corresponding author), Z Gucev (PRILOZI 44, 2023)
• A Pediatric Case of Glioblastoma Multiforme Associated With a Novel Germline p.His112CysfsTer9 Mutation in the MLH1 Gene Accompanied by a p.Arg283Cys Mutation in in the TP53 Gene: A Case Report – Aleksandra Stajkovska, Sanja Mehandziska, Rodney Rosalia, Margarita Stavrevska, Marija Janevska, Martina Markovska, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author), (Frontiers in Genetics, 2018)
• Detection of novel and reported rare disease-causing genetic mutations in Macedonia: A Collage of Case Reports – S Mehandziska, A Stajkovska, M Stavrevska, M Janevska, M Markovska, I Kungulovski, Z Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author), (EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2019)

• Trio clinical exome sequencing in a patient with multicentric carpotarsal osteolysis syndrome: first case report in the Balkans – Aleksandra Stajkovska, Sanja Mehandziska, Margarita Stavrevska, Kristina Jakovleva, Natasha Nikchevska, Zan Mitrev, Ivan Kungulovski, Gjorgje Zafiroski, Velibor Tasic, Goran Kungulovski (corresponding author) (Frontiers in Genetics, 2018)
• Progressive Familial Intrahepatic cholestasis type3 resulting from compound heterozygosity of ABCB4 mutations – N Nikcevska, S Petrovska, S Mehandziska, M Spirovski, Goran Kungulovski (corresponding author) (EUROPEAN JOURNAL OF PEDIATRICS, 2017)

Публикации во полето на Прецизната геномика

• Case report: omicron BA. 2 subvariant of SARS-CoV-2 outcompetes BA. 1 in two co-infection cases Marija Gjorgjievska, Sanja Mehandziska, Aleksandra Stajkovska, Slavica Pecioska-Dokuzovska, Anica Dimovska, Idriz Durmish, Sara Ismail, Teodora Pavlovska, Antonija Stojchevska, Haris Amedi, Jasna Andonova, Marija Nikolovska, Sara Velickovikj, Zan Mitrev, Ivan Kungulovski, Goran Kungulovski (corresponding author), (Frontiers in Genetics, 2022)
• Workflow for the implementation of precision genomics in healthcare – Sanja Mehandziska, Aleksandra Stajkovska, Margarita Stavrevska, Kristina Jakovleva, Marija Janevska, Rodney Rosalia, Ivan Kungulovski, Zan Mitrev, Goran Kungulovski (corresponding author) (Frontiers in Genetics, 2020)

• P961 CYP2C19-dependent clopidogrel resistance is a possible cause for coronary stent and peripheral bypass occlusion – M Klinceva, S Mehandziska, E Idoski, A Stajkovska, M Stavrevska, K Jakovleva, V Ampova-Sokolov, R Rosalia, Goran Kungulovski (co-author), M Blazevska, N Hristov, I Milev, Z Mitrev European Heart Journal (suppl_1), 2019)

Други публикации

• • Rhizosphere microbiomes of resurrection plants Ramonda serbica and R. nathaliae: comparative analysis and search for bacteria mitigating drought stress in wheat (Triticum aestivum L.) – Jelena Lozo, Nemanja Ristović, Goran Kungulovski (co-author), Živko Jovanović, Tamara Rakić, Slaviša Stanković, Svetlana Radović (World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2023